Wolfgang Fischer studierte Psychologie und Malerei an der Universität Wien, gefolgt von einem Filmstudium an der Kunstakademie in Düsseldorf und an der Kunsthochschule für Medien in Köln. Neben Lehrtätigkeiten arbeitete er als Assistent von Paul Morrissey und Nan Hoover. Er war Stipendiat der Drehbuchwerkstatt in München und des Drehbuchprogramms Equinoxe Europe.

Seine letzten Kinofilme sind "Was Du nicht Siehst" (2011) und "Styx" (2018), der auf mehreren internationalen Filmfestivals ausgezeichnet wurde und sich aktuell unter den drei Finalisten für den Lux Film Preis des Europaparlamentes befindet.

Er ist in Vorbereitung der Kinofilme "Der Bär", "Highway of Tears" und "Südwest".