Makiko Nishikaze erhielt bereits als Vierjährige Klavierunterricht und wurde von ihrer Klavierlehrerin intensiv in Hörerziehung geschult. Ab 1986 studierte sie Komposition bei Bin Kaneda an der Aichi University of Fine Arts and Music in Nagoya. Nachdem sie 1991 den Grad des Bachelor of Arts erworben hatte, setzte sie ihr Kompositionsstudium  bis 1993 bei Alvin Curran am Mills College in Oakland fort. Während dieser Zeit begann sie auch als Performance-Künstlerin zu arbeiten. Ab 1994 studierte Nishikaze dann bei Walter Zimmermann an der Hochschule der Künste in Berlin (Diplom 1996, Meisterschülerin 1999). 2007 war sie Dozentin an der Wakayama University, Japan.

Heute lebt und arbeitet sie als Komponistin, Pianistin und Performance-Künstlerin in Berlin; zudem gibt sie regelmäßig Konzerte, hält Vorträge und Kurse zur experimentellen Musik (u.a. für Kinder im Vorschulalter) in Deutschland und Japan.